Todos los países participantes están invitados a elaborar preguntas de prueba. Además, un equipo especializado en el área evaluada contratado por el consorcio también escribe algunas de las actividades de prueba. Las preguntas que envían los países son analizadas por el equipo internacional responsable del área foco que, entre otras cosas, controla que no haya sesgos culturales. Sólo aquellas actividades que se aprueban por consenso se utilizan en la evaluación PISA. Para el ciclo 2009, Uruguay elaboró y envió varias propuestas de actividades de prueba.
Además, el año anterior al estudio principal de esta evaluación se realiza, en todos los países participantes, una aplicación de pruebas y cuestionarios piloto para la validación de instrumentos. Las preguntas que, por los datos del piloto, resultan demasiado fáciles, demasiado difíciles o inválidas estadísticamente en algunos de los países participantes, se eliminan del diseño de prueba definitiva a aplicarse en todos los países.
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